על המשרד לביטחון הפנים מוטלת האחריות להיערכות ולמוכנות המבצעית ולהמשכיות ורציפות תפקודית של אגפי המשרד והגופים שבאחריותו - משטרת ישראל, שירות בתי הסוהר ושירותי כבאות והצלה - במצבי חירום ומצבי משבר, זאת על פי הסמכות והאחריות המוגדרות בחוק ובהחלטות ממשלה.
עיקר פעילות המשרד היא באיגוד גופי הסיוע, בתיווך ביניהם ובהפעלתם היעילה. קיימת חשיבות רבה להבטחת המשכיות ורציפות תפקודית במצבים אלו, הן של גופי הסיוע והן של המשק והחברה בכלל. הסמכות והאחריות של המשרד לביטחון הפנים מוגדרות בחוק ובהחלטות ממשלה.
המזכירות הביטחונית, מִנהלת החירום, מרכז המידע המבצעי ופורום החשיבה בעת משבר הם היחידות אשר תסייענה לשר לביטחון הפנים לממש בצורה המיטבית את סמכותו.
בנוסף להיערכות המשרד לאופן תפקודו ופעולתו בזמן חירום קיימת חובה על כל משרד ממשלתי להיערך אדמיניסטרטיבית לזמן חירום. המטה הלוגיסטי במשרד אמון על המצאת נהלים לזמן חירום, ריכוז צרכי היחידות השונות והניהול הלוגיסטי הנחוץ.
